其后，王政几经更迭，因信奉苯教的权臣作梗，佛寺及经像屡遭损毁，至八世纪初，赞普赤德祖赞执政，恢复王室信奉佛教之风，因其迎娶唐中宗之女金城公主，故得诸多汉地工匠僧侣之助，重修庙宇，塑像译经，佛教得再现生机。至赤松德赞执掌王政，仰慕先祖之德化，发心奉佛，于桑耶择地修建寺院，因权臣多为笨教徒，极力阻挠，请苯教法师暗施法术，白日所筑之基，夜间悉无踪影，工匠僧侣无端失踪，有近臣向赞普密谏：当往印度迎请高僧前来诵经禳祓。赞普遂使人前往印度请得高僧菩提萨埵(静命寂护大师) ，然而菩提萨埵无力对付苯教，劝赞普请邬金国莲花生大师入藏。莲花生大师乃莲花化生，生而成佛，乃诸佛之身语意化身，擅伏邪魔外道。赞普遂遣使备重礼往邬金国延请莲花生大师。公元七四七年，莲花生大师入藏，一路施无边法力，凡所经之地，各地凶恶神祗悉皆顺服，甘为护法。至雅鲁藏布江边，赞普率臣民恭迎，从此，莲花生大师驻锡吐蕃数十年。大师以无上威德摄服笨教徒众，权臣再不敢兴风作浪，桑耶魔患遂从此灭绝。大师于桑耶建立曼陀罗，作伏地仪轨，更腾身于空中以金刚舞加持庙基，而后择日开工建庙，历时五载方告竣工，即今之桑耶寺。

　　庙成之后，大师行开光时，天降花雨，佛像大放虹光，彻照天地，令见者无不生信。

　　应赞普诚意邀请，莲师与菩提萨埵于桑耶寺开坛授徒，弘传显密教法。先收弟子七人，即史称之"七觉士"。后七人陆续赴印度诸道场学法译经，归时又请班智达多人，于藏地共弘教法。

　　莲师驻锡藏地数十载，足迹遍及藏区各地，得大成就弟子二十五人，得灌顶传法而解脱者不记其数，传授密乘方便道，即"即身成佛"之殊胜教法，从此佛法兴盛，广为传播。因莲师预知后世教法衰落, 故于各地多设伏藏密法，分布于山腹、岩洞、江畔、河流等极隐之地，称为"岩伏藏"；又于诸甚深境中亦多设伏藏密法，称"意伏藏"，并着护法秘密守护，以待后世有缘者。藏史称此一时期为"前弘期"。

　　当莲师离藏时，从心中出一"吽"字，没入东方，此即"心意伏藏密法"之缘起。

　　公元八三八年，朗达玛谋得王位，因其崇奉笨教，执政后即大肆禁佛，佛教惨遭浩劫，显密悉无幸免，庙宇经像遭毁，密教传承渐至衰微，惟在秘中得以延续，法本所剩无几。后世记载此劫为"灭佛劫"。此后百年间，争战连连，导致吐蕃国崩溃，诸地部族割据，直至公元十世纪末叶，佛法方从阿里、青康等地回传卫藏，佛教乃得重光，此时之法因秉莲师遗教，称为"宁玛"。到十一世纪中叶，教法复得广泛弘传。时正值印度新派密教极盛之时，印藏两地，行者僧侣往来不绝，藏地密法日益兴盛，渐而形成噶当、萨迦、噶举诸派。十二世纪之后，又陆续形成诸多法流传承, 如觉域、希解、觉囊、郭扎等派。十四世纪末，宗喀巴大师融噶当派而创立格鲁派.  

　　宁玛派

　　宁玛藏语为"古"、"旧"之意，以秉承莲师所传之最古老教法而得名。朗达玛灭佛时期，传承渐弱，直至十一世纪再度振兴。其时承继法脉之行者素尔.释迦生重整典籍，掘取伏藏，遍访名师，逐渐完善法续。此后建邬巴垅寺，并以此为中心弘宁玛教法。释迦生门徒甚多，为当时宁玛派诸传承中最具影响力之一脉。其养子素尔琼. 喜饶扎巴依传承于扎贾窝修行多载，证金刚萨埵体性，得十遍处定，四大无碍，通达大圆满奥义。而后接掌邬巴垅寺，广收弟子，承传法脉。素尔琼.卓朴巴，乃喜饶扎巴之子，出生不久父即圆寂。幼时的素尔琼.卓朴巴依随其父之诸多弟子学法，尽得其父之传承，于山洞苦行二十余载，证得圆满殊胜成就，其一生数次往行藏北, 传承渐而广播。其弟子释迦金刚承传法流，并把传承分为三部：心部、界部、口诀部，统称为"大圆满法"。

　　十四世纪中叶隆钦饶降巴大师承继法流，不囿所学，曾师从诸多他派明师，通达显密教法，成就殊胜。大师一生著述甚多，依修之弟子甚众，足迹遍及藏区各地，甚至远涉不丹，为当时宁玛派诸多传承中最具影响的一脉。